生物有機肥的填充物和原料有很多，具體可以分為以下幾類：

　　1、農業廢棄物：比如秸稈、豆粕、棉粕、菇渣、沼渣、木質素渣等

　　生物有機肥廠家把秸稈作距離說明，秸稈是農作物收獲后的副產品，其種類和數量豐富，是一種寶貴的有機質資源。用稻草做有機肥，可以變廢為寶，減少環境污染。將稻草加工成有機肥后施用于土壤，可恢復作物從土壤中吸收的養分，有利于土壤養分平衡。

　　據研究，每畝還玉米秸稈500公斤，相當于施土壤混合肥2500公斤，碳氨11.7公斤，過磷酸鈣6.2公斤，硫酸鉀4.75公斤。一年后，土壤有機質含量增加0.05%~0.23%，總磷平均增加0.03%，速效鉀增加31.2 mg/kg。土壤容重降低0.03 ~ 0.16g/cm2，土壤孔隙度增加1.75%~7%。多年秸稈還田的耕地，不僅可以提高磷肥利用率，補充土壤鉀素的不足，還可以改善地理0.5~1級。秸稈還田后，畝產平均提高15%~20%。

　　2、畜禽糞便：比如牛羊馬糞、兔糞

　　畜禽糞便作為肥料回歸農田是我國農村傳統的肥料處理方法，在改善土壤和提高農業生產方面取得了良好的效果。據統計，畜禽糞便可以提供有機物，氮6314874萬噸，磷12807萬噸，鉀54172萬噸，相當于13721萬噸，鉀10843444噸，是有機物和無機物的良好來源。

　　3、工業廢棄物：比如酒糟、醋糟、木薯渣、糖渣、糠醛渣等

　　工業廢棄物有機成分含量偏低，而且不全，使用的時候需配合其他有機肥料一起使用。

　　4、生活垃圾：比如餐廚垃圾等

　　廢物是人們日常生活中的廢物，主要由爐灰、碎瓦、廢紙、廢塑料、金屬、碎玻璃、動物尸體等組成，成分極不均勻。用垃圾做肥料，不僅可以變廢為寶，還可以改善環境，有利于農業生產。廢物中含有營養物質，但是營養物質并不很高，但是數量很大，因此所提供的營養物質也不容忽視。

　　5、 沼液沼渣的開發利用，是沼氣推廣的重要內容之一。

　　多年的試驗結果表明，沼液和沼渣可以改良土壤，防治病蟲害，增加肥料田的產量。